環氧乙烷滅菌器是由于它能與微生物的蛋白質,DNA和RNA發生非特異性烷基化作用.以蛋白質為例,蛋白質上的羧基、氨基、硫氫基和羥基被烷基化,使蛋白質的正常的生化反應和新陳代謝受阻,導致微生物死亡.環氧乙烷滅菌器經水解轉化成乙二醇,乙二醇也具有一定殺菌作用.
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